W Kaplicy Wszystkich Świętych do 1912 r. znajdowała się biblioteka mariacka, skąd następnie, księgozbiór przeniesiono do biblioteki miejskiej w Gdańsku. Od 1980 r. mieści się tutaj Kaplica Ludzi Morza a ufundował ją Andrzej Bohomolec, który przed wojną jako pierwszy Polak przepłynął jachtem »Dal« Atlantyk. W czasie tego rejsu wraz z załogą znalazł się w oku cyklonu. W oczekiwaniu ostatecznej katastrofy na mocno uszkodzonym jachcie Andrzej Bohomolec postanowił, że ufunduje kaplicę ku pamięci spoczywających na dnie mórz i oceanów marynarzy. Projektantami i wykonawcami kaplicy są Stanisław Konieczny i Janina Karczewska-Konieczna z Gdańska. Techniką ceramiczną wykonali oni statuę Matki Boskiej Królowej Dalekich Mórz i Oceanów, ołtarz morski. sceny biblijne o tematyce morskiej na ścianie kaplicy, żyrandol i inne elementy.
Wejście do kaplicy ujęte jest w barokowy portal z XVII stulecia. Wykonany on jest z piaskowca i polichromowany.